• facebook
  • linkedin
  • youtube

Post kiam la amerika akademiulo Eric S. Lander formale proponis ununuran nukleotidan polimorfismon (SNP) kiel la triageneracian molekulan signon en 1996, SNP estis vaste uzita en ekonomia trajta asocio-analizo, biologia genetika ligmapkonstruo, kaj homa patogena genrastrumo., Malsana risko-diagnozo kaj antaŭdiro, individuigita drogkribrado, kaj aliaj biologiaj kaj medicinaj esplorkampoj.En la kampo de monkultivaĵbredado, detekto de SNP povas realigi fruan elekton de postulataj trajtoj.Ĉi tiu elekto havas la karakterizaĵojn de alta precizeco kaj povas efike eviti la interferon de morfologio kaj mediaj faktoroj, tiel multe mallongigante la reproduktan procezon.Tial, SNP ludas grandegan rolon en la kampo de baza esplorado.

Single Nucleotide Polymorphism (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) rilatas al la fenomeno ke ekzistas ununuraj nukleotiddiferencoj en la sama pozicio en la DNA-sekvenco de individuoj de la sama aŭ malsamaj specioj.La enmeto, forigo, konvertiĝo kaj inversigo de ununura bazo povas ĉiuj kaŭzi ĉi tiun diferencon.En la pasinteco, la difino de SNP estis diferenca de tiu de mutacio.Variaĵlokuso postulas ke la frekvenco de unu el la aleloj en la populacio estas pli granda ol 1% por esti difinita kiel SNP-lokuso.Tamen, kun la vastiĝo de modernaj biologiaj teorioj kaj la apliko de teknologio, alela frekvenco jam ne estas necesa kondiĉo por limigi la difinon de SNP.Laŭ la ununuraj nukleotidaj variodatenoj inkluditaj en la Single Nucleotide Polymorphisms (dbSNP) datumbazo sub la National Center for Biotechnology Information (NCBI), malaltfrekvenca enmeto/forigo, mikrosatelita vario, ktp.

SNP molekula etikedado kaj detekto1

En la homa korpo, la ofteco de SNP estas 0.1%.Alivorte, estas mezumo de unu SNP-ejo po 1000 bazparoj.Kvankam la ofteco de okazo estas relative alta, ne ĉiuj SNP-ejoj povas esti kandidatsignoj ligitaj al trajtoj.Tio estas plejparte rilatita al la loko kie la SNP okazas.

Teorie, SNP povas okazi ie ajn en la genarsekvenco.SNP-oj okazantaj en la kodregiono povas produkti sinonimajn mutaciojn kaj ne-sinonimajn mutaciojn, tio estas, la aminoacido ŝanĝiĝas aŭ ne ŝanĝiĝas antaŭ kaj post la mutacio.La ŝanĝita aminoacido kutime igas la peptidĉenon perdi sian originan funkcion ( missenca mutacio ), kaj ankaŭ povas kaŭzi tradukon abortas ( sensenca mutacio ).SNPoj kiuj okazas en ne-kodigaj regionoj kaj intergenaj regionoj povas influi mRNA-splisadon, ne-ĉidigan RNA-sekvencokunmetaĵon, kaj la ligan efikecon de transkripcifaktoroj kaj DNA.La specifa rilato estas montrita en la figuro:

SNP-Tipoj:

SNP molekula etikedado kaj detekto2

Pluraj oftaj SNP-tajpmetodoj kaj ilia komparo

Laŭ malsamaj principoj, oftaj SNP-detektometodoj estas dividitaj en la sekvajn kategoriojn:

Klasifika komparo de detektaj metodoj

SNP molekula etikedado kaj detekto3

Noto: Listigita en la tabelo estas nuntempe uzataj pli oftaj SNP detekto metodoj, aliaj detekto metodoj kiel specifa retejo hibridigo (ASH), specifa retejo primer etendo (ASPE), ununura bazo etendo (SBCE), specifa retejo kortego (ASC), geno blato teknologio, maso spektrometrio teknologio, ktp ne estis klasifikitaj kaj komparitaj.

La kosto kaj tempo de nukleaacida purigo en ĉi-supraj pluraj oftaj SNP-detektometodoj estas neeviteblaj.Tamen, rilataj ilaroj bazitaj sur la rekta PCR-teknologio de Foregene povas rekte elfari PCR aŭ qPCR plifortigon sur nepurigitaj provaĵoj, kiu alportas senprecedencan oportunecon al SNP-detekto.

La rektaj PCR-serioproduktoj de Foregene simple kaj proksimume preterlasas specimenajn purigajn paŝojn, kio multe reduktas la tempon kaj koston necesajn por prepari ŝablonojn.La unika Taq-polimerazo havas bonegan plifortigan kapablon kaj povas toleri diversajn inhibintojn de kompleksaj plifortigaj medioj.Ĉi tiuj karakterizaĵoj provizas teknikan garantion por akiri alt-rendimentajn specifajn produktojn.Foregene Direct PCR/qPCR-kompletoj por diversaj specimenaj specoj, kiel: bestaj histoj (rata vosto, zebrofiŝo, ktp.), plantfolioj, semoj (inkluzive de polisakaridoj kaj polifenolaj specimenoj), ktp.


Afiŝtempo: Jul-23-2021